md5sum verifikation af flere bibliteker.

Jeg er blevet sat til at skulle lave et program til at verificere om den backup vi har brændt på DVD og også i sammenligning med det der ligger på serveren (Linux), til det har jeg fået anbefalet "MD5SUM".

Problemet er bare at så vidt jeg kan se, at man ikke kan verificere flere biblioteker på en gang. Er det sandt eller hvordan gør jeg??

En anden ting er at bibliotekerne indeholder nogen gange mere 20.000 filer og så går den i stå når vi kører md5sum på det givne bibliotek.
Er det et Linux eller md5sum problem og kan det løses?

Er der andre programmer derude som vil kunne gøre det samme og som også kan tage alle biblioteker med på en gang.