Avatar billede mikall Nybegynder
24. september 2003 - 18:09 Der er 3 kommentarer og
1 løsning

Søgning på RNA sekvens

Jeg skal søge efter en bestemt mRNA sekvens i en database.

Sekvensen kan fx hedde GGGCAT. 

I databasen er de forskellige sekvenser desværre listet som følger:

ccctgcccgt cctgagcctc cccgagctcc cttctcaccc tcaccatggc caagggattc tacatttcca aggccctggg catcctgggc atcctcctcg gcgtggcggc cgtggccacc atcatcgctc tgtctgtggt gtacgcccag gagaagaaca agaatgccga gcatgtcccc

Altså med mellemrum mellem hver 10. base.

Det hit jeg gerne vil have kan godt strække sig over to grupper, fx GGG CAT. Mit spørgsmål lyder så:
Hvordan søger jeg efter min specielle sekvens med funktionen "-> Rediger -> Søg (på denne side)", hvis min sekvens skal findes på trods af et mellemrum? 

/Mikkel
Avatar billede erikjacobsen Ekspert
24. september 2003 - 18:39 #1
Kan du ikke bare lave en kopi uden mellemrum specielt til at søge i?
Avatar billede mikall Nybegynder
24. september 2003 - 18:40 #2
Jo men det vil tage timer at lave, hvis jeg skal sidde og fjerne hvert mellemrum
Avatar billede erikjacobsen Ekspert
24. september 2003 - 18:50 #3
Du skal jo ikke selv gøre det ;))  Jeg har ikke helt forstået hvor data kommer fra?

En almindelig god editor kan vel gøre det.
Avatar billede mikall Nybegynder
24. september 2003 - 20:18 #4
jeg har selv fundet en løsning ved at copy/paste det ind i et .doc dokument, og så erstatte mellemrum med i "Ingenting"
Avatar billede Ny bruger Nybegynder

Din løsning...

Tilladte BB-code-tags: [b]fed[/b] [i]kursiv[/i] [u]understreget[/u] Web- og emailadresser omdannes automatisk til links. Der sættes "nofollow" på alle links.

Loading billede Opret Preview
Kategori
Computerworld tilbyder specialiserede kurser i database-management

Log ind eller opret profil

Hov!

For at kunne deltage på Computerworld Eksperten skal du være logget ind.

Det er heldigvis nemt at oprette en bruger: Det tager to minutter og du kan vælge at bruge enten e-mail, Facebook eller Google som login.

Du kan også logge ind via nedenstående tjenester

IT-JOB

Det Nationale Forskningscenter for Arbejdsmiljø

IT-sikkerhedsspecialist med fokus på AI inden for forskning

Netcompany A/S

IT Consultant

Scan Global Logistics

PMO Project Manager

Capgemini Danmark A/S

Microsoft AI Solution Architect