forskellige hdd´er til windows og linux

........ PC booter på masterdisk som har en fejlbehæftet linux installeret, derfor skal der under boot vælges DOS, som ligger på anden (fysiske) disk, og så starter XP. Men nu vil jeg gerne formatere/fdiske master, men slave (XP) kan ikke boote, og windows bootdiskette kan ikke se master (linux) disk. Så jeg kan ikke starte PC uden master, som jeg ikke kan bruge til andet end bootdisk. Hvad gør jeg? Vil helst ikke slette slavedisk hvor de fleste af mine filer ligger. Med andre ord, jeg skal have fdisket Masterdisk, og have slave til at boote. Er det fordi XP ligger på slave, kan jeg så flytte jumper så XP er master, det vil vel ikke ændre noget??