Invalid partition table - low level format?

Jeg har to 80 gb hd i min pc.
Den ene har jeg kun data på, den anden har jeg opdelt i hhv. 20 og 60 gb partitioner. 20 gb partitionen er til installation af XP og programmer.

Jeg er igang med at reinstallere XP og programmer, men får følgende fejlmeddelelse:

Invalid partition table

Det sker efter jeg har brugt min XP cd til at formattere partition og kopiere XP filer over. Når pc så skal genstarte er der sort skærm og ovenstående fejlmeddelelse.

Jeg så et andet eksperten spm. (http://www.eksperten.dk/spm/316703) som omhandlede det samme hvor spørger blev rådet til at lave en low level format.

Jeg fandt følgende på seagates hjemmeside:
http://www.seagate.com/support/kb/disc/faq/ata_llfmt_what.html

Og nu (endelig) til spørgsmålene:

1) vil en low level format i alle tilfælde betyde at jeg formatterer _hele_ harddisken, altså begge partitioner? (Jeg har nemlig data på 60 GB partitionen som jeg ikke har nogen steder at gøre af)
Eller vil jeg kunne vælge kun at low level formattere 20 GB partitionen?

2) kan jeg gøre noget andet for at fixe min "invalid partition table"?

mvh
Thomas