Problem med session

Hej,
jeg har et underligt problem med en session... den hedder session("msg") og indeholder bare en besked, som f.eks. "Beskeden er sendt"! Når session("msg") ikke er tom laves en popup der indeholder beskeden, eller burde indeholde beskeden... her er koden:

<%
if session("msg") <> "" then
%>
    <script>
    winStats='toolbar=0,location=0,menubar=0,scrollbars=0,height=80,width=300'
    win = window.open("msgs.asp","",winStats)
    </script>
<%
session("msg") = ""   
end if
%>

og msgs.asp ser således ud:
<table width="100%" border="0" cellspacing="0" cellpadding="3">
  <tr>
    <td align="center" valign="middle"><font size="3" color="#FF0000"><%=session("msg")%></font><br><br><a href="java script:onClick=window.close();"><u>Luk vinduet</u></a></td>
  </tr>
</table>


Det underlige er at når filerne ligger i roden virker det ikke, men hvis filerne ligger i en undermappe virker den samme kode fint! Den kommer ikke med nogle fejl, session("msg") bliver bare ikke udskrevet hvis filerne ligger i roden.. nogle der har nogle foreslag?