Det er helt generel sikkerhed du skal ind på. Et hackerangreb foregår normalt sådan:
Hackeren finder en åben port samt hvad der gemmer sig bag de åbne porte. Herefter finder han sårbarheder han kan udnytte.
Du bør hardne dit system, her taler jeg om hele systemet, operativsysten, alle programmer derer installeret, isæt din ftp server.
At hardne indebær fuld opdatering, fjerning af usikre tjenester, opstraning af rettigheder, opstramning af firewall m.m.
Du kan her læse en del artikler om hvad du mere præcist skal gøre
http://www.eksperten.dk/artikler/Sikkerhed/