Vælg alle checkboxe i repeater

Denne linie:
  CheckBox chk = (CheckBox) item.FindControl("cbAll");
giver dig vel den checkbox du bruger til 'marker alle'

Så
  if (chk.Checked == false)
    chk.Checked = true;
sætter 'marker alle' boksen checked, hvis den var unchecked...

Det skal vel snarere være:
  protected void cbAll_OnCheckedChanged(object sender, EventArgs e)
  {
    CheckBox checkAll = sender as CheckBox;
    if(checkAll != null)
    {
      bool isChecked = checkAll.Checked;

      foreach (RepeaterItem item in repeater.Items)
      {
        CheckBox chk = item.Controls[/*index af checkbox i repeateritem her*/] as CheckBox;
        chk.Checked = isChecked;
      }
    }
  }

Og så skal du huske at sætte AutoPostback = true på 'marker alle' boksen.
Alternativt ville det være oplagt at lave sådan noget i javascript, da det hurtigt kommer til at virek dtungt at siden skal postback'e når man markerer alle...