Kopiering af store mængder data fra ekstern hdd

Jeg har en stor mængde filer liggende på en ekstern hdd (ca. 140 GB).
Da jeg har anskaffet mig en stationær computer med 1 TB hdd, kunne jeg godt tænke mig at kopiere disse filer over på denne.

For det første kan jeg åbenbart ikke få lov at tage det hele på engang (copy/paste), jeg kan godt overføre en mindre del af gangen, men der kommer hele tiden fejlmeddelelser.
Kan problemet skyldes, at mappestrukturen på den eksterne hdd er opbygget via styresystemet på min bærbare (Ubuntu)? Jeg kører XP på min stationære.

Jeg erindrer svagt, at én engang fortalte mig, at der var noget med forskel mappestrukturen - eller sådan noget??

Håber nogen kan hjælpe mig med at opklare mysteriet.