Mini-ITX med ekstern strømforsyning

Jeg har lige købt mig en af de små Mini-ITX bundkort med en tilhørende Cubid 3688 kasse. Kassen har en ekstern strømforsyning (ala dem til bærbare PC'er) og en konverteringsdims inde i selve kabinettet, der så går videre til bundkortets ATX-stik.

Jeg har et noget mystisk problem: Ofte kan jeg ikke få maskinen til at boote. Når den er kold er der ingen problemer, men hvis den har stået tændt et stykke tid, og man slukker den og prøver at tænde den igen umiddelbart efter, så sker der enten ingenting eller også kommer der lys i power-lampen og der sker ikke mere. Lader man den hvile en 10-20 minutter kan den tænde igen.

Jeg har nu prøvet at slutte det hele til, men hvor bundkortet ligger ved siden af kabinettet, og så er der slet ingen problemer. Er der nogen der har en forklaring på dette, og hvordan man kunne løse det?