Starter jeg tråden op korrekt?

Jeg kan ikke se noget galt i din kode der. Det er nok i run metoden i din clienthandler den er gal. I den kode du har posted opretter du jo blot en ny instans af ClientHandler og mere er der jo ikke i det - bortset fra at kalde start.

Prøv at poste koden i run-metoden på din ClientHandler.

Clienthandler kode:
public void run()
    {
        try
        {
            BufferedReader in = new BufferedReader(new InputStreamReader(link.getInputStream())); //Step 3.
            PrintWriter out = new PrintWriter(link.getOutputStream(),true); //Step 3.
            String message = in.readLine();
            Commands com = new Commands(in,out);
            while(!message.equals("***CLOSE***"))
            {
                if(message.equals("listtxt")) // List all txt files on server
                {
                    com.listtxt();
                }
                else
                {
                    out.println("Command not valid");
                }
                message = in.readLine();
            }
           
           
        }
        catch(IOException e)
        {
            e.printStackTrace();
        }

        finally
        {
            try
            {
                System.out.println(
                                "\n* Closing connection... *");
                link.close();                    //Step 5.
            }
            catch(IOException e)
            {
                System.out.println("Unable to disconnect!");
                System.exit(1);
            }
        }
    }

Får du udskrevet nogen exception?

Jep - Giv mig 5 min så kommer de med :)

Øhh - Jeg tror sku jeg har fundet fejlen da jeg skulle prøve at genere fejlen igen. Fejlen ligger i clienten vil jeg tro. Jeg undersøger lige nærmere om det faktisk er der problemet ligger. Tak for din hjælp indtil videre i hvert fald.

Problemet opstår i at jeg har en kommando i clienten som giver svar tilbage på client siden, men ikke serversiden. Og jeg tror client forventer svar fra clienten i den kommando og fejl så derefter.

Rettelse - Jeg skriver til serveren uden det er nødvendigt, og den sender et svar tilage som clienten får. Når så næste kommando udføres får den forkert svar - Det er protokollen der er gået kuk. :D    Tak fordi du fik mig til at teste det igen.

Yes - Det var fejlen - Smider du lige et svar :)

Kommer her...