I 2006 indskydes yderligere to milliarder kroner i regeringens prestigeprojekt, Højteknologifonden, så fonden i alt kommer op på en formue på fem milliarder kroner. Det er resultatet af finanslovsaftalen mellem Dansk Folkeparti og regeringen, som blev indgået tidligt mandag morgen.
På baggrund af den nyindskudte kapital er det aftalt at fonden i 2006 skal udbetale 200 millioner kroner til forskning og udvikling i danske virksomheder.
Samtidig er Dansk Folkeparti og regeringen blevet enige om at oprette en særlig forskningsreserve på 175 millioner kroner, som primært er øremærket til initiativer som "spydspidsprofessorer", forskeruddannelse og flere erhvervs-Ph.D.'er på det naturvidenskabelige område.
Sammen med aftalen fra slutningen af oktober mellem regeringen, SF, Socialdemokratiet og de radikale om at bruge 855 millioner kroner af provenuet fra salget af 3G-licenser på forskning, betyder det at der bevilges i alt 1,5 milliarder kroner til forskning i de kommende fire år.
