32 dual PowerMacs samlet til Danmarks største tænketank

DTU tænder mandag for nordens kraftigste dedikerede Mac-cluster. 32 dobbelt processor-baserede Apple Power Mac's er koblet sammen til én samlet, med praktisk ydelse på 200 Gigaflop. DTU skal bruge supercomputeren til at forstå proteiners færden og indflydelse på kræft. Men den er også yderst velegnet til store grafiske opgaver som film og animationer.

Flere hundrede mennesker over hele verden kan samtidigt benytte sig af de op til 64 millioner instrukser i sekundet som supercomputeren, Velocity X, foretager. Det svarer til ca. 6 millioner beregninger i sekundet. Man kobler sig på over internettet med tilladelse fra DTU.

Prisen for Velocity X er ca. 3,5 million kroner, hvilket taget stabiliteten og ydeevnen i betragtning er yderst rimeligt. Tilsvarende PC-clusters koster 5-10 millioner kroner afhængig af fabrikat. Supercomputeren kan lejes for ca. 50.000 kroner om ugen.

Velocity X er blandt de kraftigste computere i verden når det kommer til vektorberegninger og film animationer. Projektleder bag supercomputeren, Lars Rex, venter at mange mennesker fra hele verden vil leje Velocity X og koble sig på over internettet - altså sidde i New York og foretage beregninger på Lundtoftesletten.

Velocity X står hos Kvante og Protein Centeret, QUP, på Danmarks Tekniske Universitet i Lundtofte. Afdelingsleder og lektor Henrik Bohr ønskede en supercomputer som kunne simulere proteiner på kvante niveau. Herved kunne Henrik Bohr teoretisk beregne og forstå proteiners færden og indflydelse på kræftceller.

Lektor Henrik Bohr har udviklet tænketanken sammen med projektleder Lars Rex, softwareansvarlig Thomas Mandrup, grafiker Tommy Almind og Apple Computers. Det har taget omkring 1 år at skabe Velocity X fra bunden til fuld operationel.

Tekniske specifikationer:

32 noder med følgende konfiguration:
- Dual 800Mhz G4
- 1.5Gb RAM
- 60GB Harddisk
- 1000/100/10BaseT

1 master med følgende konfiguration:
- 800Mhz G4
- 512Mb RAM
- 60GB harddisk
- 1000/100/10BaseT

Netværks konfiguration:
- HP4000M switch
- 100BaseT Ethernet

Clusteret er bygget op omkring 32 dual 800Mhz G4 workstations fra Apple, hvilket giver en praktisk ydelse på 190 til 200Gflop, backbonet er leveret af HP og består af en HP4000M modul baseret switch med mulighed for udbygning til op til 80 100/10BaseT ethernet forbindelser.

Skelettet er bygget af genbrugs profiler fra elektronik racks at ældre dato. Dette blev valgt da det var økonomisk rantabelt. Proces kommunikation foregår gennem parallelle programerings miljøer som MPI, Charm++ og PVM.