SCO rejste i marts 2003 sag mod IBM, hvor de krævede en erstatning på 1 milliard dollars for at anvende Linux-kode, som SCO hævder at have ophavsrettighederne til.
1. april 2003 nåede kravet op på 3 milliard dollars, og nu, næsten et år senere, er erstatningskravet igen steget med 2 milliarder dollars. Det lyder nu på 5 milliarder dollars.
Linux og SCO's Unix ligner hinanden på mange måder. Linux er baseret på åben kildekode, og kan frit udvikles af alle interesserede, hvorimod Unix er licenseret.
SCO hævder, at IBM illegalt anvender Unix-teknologi i Linux. Ifølge SCO er Unix System V illegalt inkorporeret i Linux kildekode.
Sagen er en af tre, som SCO er involveret i vedrørende Unix-Linux-spørgsmålet. SCO kræver ligeledes erstatning fra Novell for lignende overtrædelser.
Endvidere har Red Hat, der er førende distributør af Linux-operativsystemet, rejst sag for at deklarere, at Red Hat ikke har krænket SCOs rettigheder.
Det vurderes, at netop SCOs kontroverser med Linux er årsag til, at internetormen MyDoom.A blev programmeret til at ramme SCO, hvilket har resulteret i, at SCOs oprindelige internetside har været nede siden slutningen af januar.
