Windows 98 Second Edition kommer ifølge de seneste oplysninger fra Microsoft ikke på markedet i to, men hele tre versioner; Full, som skal bruges, hvis man ikke i forvejen har Windows installeret på pc'en, Upgrade, som opgraderer fra tidligere Windows-versioner og StepUp, der er rettet mod brugere med Windows 98. Den sidste version indeholder forskellige rettelser og udvidelser til styresystemet, der ellers skulle have været en del af Service Pack 1 (SP1). StepUp kommer som de andre versioner til at koste 89 dollars. Det betyder, at en opgradering fra Windows 98 til Windows 98 SE kommer til at koste det samme som opgradering fra Windows 95 til Windows 98. Til trods for, at der er tale om forholdsvis få rettelser og ændringer, som normalt kan hentes gratis fra Microsoft's web-sted. Mange brugere har kritiseret, at det nu tilsyneladende skal koste penge at få rettelser til fejl i styresystemet. Men Microsoft forsikrer, at rettelserne også vil kunne hentes gratis på Internet.
Microsoft Windows 98 Second Edition bliver udsendt til efteråret. (Kilde: CNET)